1、因体质酸化身体发生其他组织的癌变，又因身体机能下降，身体组织液酸化，造成了卵巢囊肿。
2、身体组织液酸化，身体细胞处于酸性体液中，进而形成身体正常细胞溶氧量下降，造成细胞的活性下降，代谢循环减慢，下降到正常值的65%时，正常细胞就无法生存，但也有不惜改变染色体采取主动变异的细胞，细胞的表型发生改变，肿瘤性状得以表达，这些细胞迅速扩增，从而形成真正的肿瘤实体。
3、长期的饮食结构，生活习惯不好、心理压力过大等因素造成体质过度酸化，人体整体的机能下降，引起肾虚，肝肾同源，肾虚肝亦虚，进而引起下焦代谢循环变慢，造成卵巢疾病和内分泌失调，免疫功能下降，从而发展为卵巢组织异常增生，终致卵巢囊肿，甚至癌变。
4、下丘脑-垂体-卵巢轴功能异常说：下丘脑-垂体功能异常主要表现在患者有过多LH分泌无周期性改变及LH峰出而FSH的分泌正常或稍低从而LH/FSH比值增加LH直接作用于卵巢的卵泡膜细胞通过增加细胞内支链裂解P450c17a的活性使卵巢内卵泡膜细胞产生过多雄激素临床上很多卵巢囊肿患者和多囊卵巢综合征患者的基本病理生理改变是卵巢产生过多雄激素而雄激素的过量产生是由于体内多种内分泌系统功能异常协同作用的结果
5、体腔上皮化生学说：女性生殖系统上皮卵巢生殖上皮及盆腔腹膜胸膜均起源于体腔上皮当受到炎症创伤雌激素过高等因素的影响时或体腔上皮反复受经血激素或慢性炎症的刺激可以化生为子宫内膜样组织形成子宫内膜异位症80%的子宫内膜异位症发生在卵巢与卵巢生发上皮的化生潜能有关但目前很多学者认为腹膜刺激合并子宫内膜异位症是果而不是因而且腹膜刺激都发生在异位灶以外的部位
6、免疫学说：有人认为在妇女免疫功能正常的情况下月经期经输卵管流入腹腔的内膜细胞为主的局部免疫系统所杀灭若局部免疫功能不足或逆流腹腔内的内膜细胞数量过多时免疫细胞不足以将杀灭即发生子宫内膜异位症也有报道子宫内膜异位症患者有红斑狼疮或其它自身免疫疾病史者为无该病患者的两倍。
从实验结果表明在子宫内膜异位症患者血清中lgG及抗子宫内膜自身抗体较对照组明显增加其子宫内膜中的lgG及补体C3沉积率亦高于正常妇女故认为子宫内膜异位症可能是一种自身免疫性疾病目前认为子宫内膜异位症患者既可有体液免疫即B细胞应答反应增强亦可有细胞免疫即T 细胞免疫功能不足上述免疫功能的异常是内膜异位的原因还是内膜异位的结果仍有待确定。
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